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知网参考文献一般不查重，而且论文的参考文献是一般是不需要查重的，而且知网检测系统时，就算把全部的论文上传上去，知网检测查重系统也是可以识别正确的目录和参考文献并剔除，不参与正文检测。 但是也千万不要图省钱，把参考文献哪些不参考查重的地方省略了。
知网论文查重系统计算的总字数，是Word文档里统计的字符总数(计空格)，而不是单纯的依据Word里所统计的字数。 所以说，不合理的排版（空格）格式，对于各位专家学者们进行知网论文查重是有着不小的阻碍作用的。 知网查重时表格里面的内容也会算字数，而简单的Word统计的时候一般表格统计不到字数。 这也就是说，知网论文查重入口可以有效的辨别表格是否是重复的的问题。 每篇文章基本都会有英文摘要或者英文参考文献，对于英文更占字符数了。
但是像我所在的浙江大学，学校为学生购买了知网查重服务，并集成到研究生管理系统了，而且， 用于查重的论文版本也是最终送审的版本 。 这意味着，删除参考文献是不可取的，因为送审版本是需要包括参考文献的。