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论文注释按照注释放置的位置可以分为当页脚注和参考文献。当页页下的脚注就是在该页面对本页文中引用的文献资料进行注释，而参考文献就是把所有的参考文献放在论文的最末尾，单独作为一个板块。我们分两部分来介绍这两种注释。脚注的添加方法
查阅文献的时候，如果你看到的是文献的全文，作者名字都是完全显示出来的，那么一般就是名在前姓在后了；如果你在数据库，比如Pubmed里检索到摘要，那通常是姓是全拼出来的，而名字只剩缩写了（Smith J）。 其实，引用文献不一定要提到作者的名字。 如果每句话都加上作者的名字，会影响文章阅读起来的流畅性。
在获取参考文献时由于来源不同，捕获的杂志名称格式也不同，有时为全称，有时为不加点的缩写，有时为加点的缩写，这在引用时会造成一些麻烦，使得论文中参考文献来源的杂志名字不统一。 而这一点，不能单纯的通过修改Endnote-output style来解决。
如果你引用的文献有两个作者，普遍接受的写法是两个作者的姓都要写上：Smith and Zhang (2008) reported… 三个或更多作者的时候，除非期刊关于列出几个作者有特别规定，只需要写出第一作者 + et al. 从上面的例句还可以看出，如果你引用文献时提到了作者的名字，也要加上发表的年份，不论文献的格式排版如何。 中国作者在这方面容易出现的一个错误是用全名，尤其是在提到中国作者的名字时。 用中文写论文时可能这种写法是普遍接受的，但是要记住用英文写的时候只要姓就可以了。 另一个常见错误是 姓和名混淆 ，这可能是因为英文里名在前，姓在后，和中文习惯相反造成的。