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查重的目的是防止大段抄袭他人的论文。 这两者在基于实验/案例的论文中还是不容易冲突的（因为实验都要自己做，案例大都也要自己分析）。 比较类的论文我倒没写过，不过我猜应该重点会是为什么各个论文作者会有不同的观点吧。
引用不是照搬照抄，而是一种学术理论的借鉴，可以引用别人的句子，但是整体的理解要用自己的语言去解读。 引用只是为了证明自己的论点，但不能把别人的理论照搬过来，否则就会直接淘汰的，所以查重和引用其实是不冲突的。
全文有一个重复部分，一个部分是删除被引用文献的重复率，因此，一般来说，即使作者引用其他论文，也只需证明引文的模式是正确的。 一般情况下，它将被知网论文查重系统自动识别为引用部分，以绿色字体标记，并显示删除引用文献的重复率。
根据已有研究成果及经验，一般的基础研究、理论研究论文引用的参考文献数量在10篇左右，综述性论文引用的文献数量可以多一些，技术性、实验性论文引用文献相对较少。 参考文献的选择，应该根据文章的需要来确定，以数量最少、质量最优、作用最佳、成果最新为基本原则。